Dopo cinque anni nelle file dell'Huracán, in prima e seconda divisione argentina, senza peraltro riuscire ad imporsi come titolare (7 presenze complessive), milita nella stagione 2005-2006 nel Palermo. Inizialmente considerato il terzo portiere della rosa alle spalle di Matteo Guardalben e Nicola Santoni, a seguito dell'infortunio di Guardalben riesce a superare Santoni nelle gerarchie interne e a trovare spazio in formazione, esordendo in Serie A il 26 ottobre 2005 nel successo interno per 3-0 contro il Lecce.

Con la sessione invernale del calciomercato, che vede la società siciliana cedere Guardalben e Santoni ed acquistare Federico Agliardi, Andújar torna prevalentemente in panchina. Conclude la stagione con 11 presenze in campionato, 7 in Coppa UEFA e 3 in Coppa Italia.

Nel 2006 passa all'Estudiantes, in Primera división argentina, squadra con cui conquista da titolare il titolo di Apertura 2006, dopo lo spareggio col Boca Juniors.

Il 24 giugno 2009 il Catania (tramite il proprio sito internet) ufficializza l'acquisto di Andújar, il portiere argentino si lega infatti alla Società etnea con un contratto quadriennale. Però verrà presentanto alla stampa nel mese di luglio, per via dell'impegno della coppa libertadores che dovrà affrontare con il club Estudiantes De La Plata(ormai sua ex squadra).

Il 6 giugno 2009 esordisce in Nazionale da titolare nella sfida Argentina-Colombia, vinta dai padroni di casa per 1-0. Gioca titolare anche la sfida seguente con l'Ecuador (sconfitta per 2-0), rimpiazzando il precedente numero 1 argentino Carrizo.